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Biblioteca(s):  Embrapa Agricultura Digital.
Data corrente:  07/02/2012
Data da última atualização:  13/01/2020
Tipo da produção científica:  Resumo em Anais de Congresso
Autoria:  DITA, M.; HERAI, R.; YAMAGISHI, M.; FERREIRA, G.; SOUZA, M.; GIACHETTO, P.; WAALWIJK, C.; KEMA, G.
Afiliação:  Bioversity International, Turrialba; Unicamp; MICHEL EDUARDO BELEZA YAMAGISHI, CNPTIA; GILVAN FERREIRA DA SILVA, CPAA; MANOEL TEIXEIRA SOUZA JUNIOR, CNPAE; POLIANA FERNANDA GIACHETTO, CNPTIA; Plant Research International, Wageningen; Plant Research International, Wageningen.
Título:  Comparative transcriptome analyses of Fusarium oysporum f. sp. cubense.
Ano de publicação:  2011
Fonte/Imprenta:  Phytopathology, v. 101, n. 6, Supplement, p. S43, 2011.
Idioma:  Inglês
Notas:  Trabalho apresentado no: APS-IPPC 2011 Joint Meeting in Honolulu, Hawaii, August 6-10, 2011.
Conteúdo:  Fusarium oysporum f. sp. cubense (FOC), the causal agent of Panama disease of banana is a highly destructive and genetically diverse pathogen. Despite its economic importance, genomic information of FOC is poor and no transcriptomic analyses have been reported so far. By using 454 sequencing technology, we generated >2.5 million expressed sequenced tags (ESTs) from four FOC strains representing four different Vegetative Compatibility Groups and the four described races that infect banana: race 1 (R1), race 2 (R2), subtropical race 4 (SR4) and tropical race (TR4).
Palavras-Chave:  Mal do Panamá na banana; Transcriptoma.
Thesagro:  Doença de Planta.
Thesaurus Nal:  Fusarium oxysporum f. sp. cubense; Plant diseases and disorders; Transcriptome.
Categoria do assunto:  --
Marc:  Mostrar Marc Completo
Registro original:  Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA)
Biblioteca ID Origem Tipo/Formato Classificação Cutter Registro Volume Status URL
CNPTIA16433 - 1UPCRA - DD
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1.Imagem marcado/desmarcadoHERAI, R. H. Metodologias de bioinformática para detecção e estudo de sequencias repetitivas em loci gênicos de transcritos quiméricos. 2010. 178 p. Tese (Doutorado em Genética e Biologia Molecular na Área de Bioinformática) - Instituto de Biologia, Universidade Estadual de Campinas, Campinas. Orientador: Michel Eduardo Beleza Yamagishi.
Tipo: Orientação de Tese de Pós-Graduação
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2.Imagem marcado/desmarcadoHERAI, R. H.; YAMAGISHI, M. E. B. A bioinformatics approach to detect interchromosomal trans-splicing in bovine full length cDNA databanks. In: PLANT & ANIMAL GENOME CONFERENCE, 18., 2010, San Diego. Abstracts... [S.l.: s.n.], 2010. Não paginado. P869. PAG-XVIII.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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3.Imagem marcado/desmarcadoGIACHETTO, P. F.; HERAI, R. H. BOS_ANNOTATION: Pipeline baseado em bancos de dados públicos para associação e anotação automática de transcriptomas bovinos. Versão 1.0. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2011. 1 CD-ROM.
Tipo: Software
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4.Imagem marcado/desmarcadoYAMAGISHI, M. E. B.; HERAI, R. H. Chargaff's "Grammar of Biology": new fractal-like rules. In: INTERNATIONAL PLANT & ANIMAL GENOME, 21., 2013, San Diego. [Abstracts...]. [S.l.: s.n.], 2013. Não paginado. Pôster P1003.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
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5.Imagem marcado/desmarcadoYAMAGISHI, M. E. B.; HERAI, R. H. Chargaff. Versão 1.0. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2012. 1 CD-ROM.
Tipo: Software
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6.Imagem marcado/desmarcadoYAMAGISHI, M. E. B.; HERAI, R. H. FastaSequenceTools. Versão 1.0. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2009. 1 CD-ROM.
Tipo: Software
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7.Imagem marcado/desmarcadoFALCÃO, P. R. K.; HERAI, R. H. FOC-Control. Versão 1.0. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2010. 1 CD-ROM.
Tipo: Software
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8.Imagem marcado/desmarcadoFALCÃO, P. R. K.; HERAI, R. H. Foc-Web. Versão 1.0. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2010. 1 CD-ROM.
Tipo: Software
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9.Imagem marcado/desmarcadoYAMAGISHI, M. E. B.; HERAI, R. H. FusionFinder. Versão 1.0. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2009. 1 CD-ROM.
Tipo: Software
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10.Imagem marcado/desmarcadoYAMAGISHI, M. E. B.; HERAI, R. H. RepGraph. Versão 1.0. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2009. 1 CD-ROM.
Tipo: Software
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11.Imagem marcado/desmarcadoYAMAGISHI, M. E. B.; HERAI, R. Identification of repetitive sequences within gene loci. In: INTERNATIONAL PLANT & ANIMAL GENOME, 20., 2012, San Diego. Abstracts... Jersey City: Scherago International, 2012. 1 pôster. PAG 2012. P0983.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
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12.Imagem marcado/desmarcadoHERAI, R. H.; YAMAGISHI, M. E. B. Detecting evidences of inter-chromosomal trans-spliced genes using a bioinformatic approach. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 4., 2008, Salvador. Proceedings... Salvador: AB³C, 2008. Não paginado. X-meeting 2008.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
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13.Imagem marcado/desmarcadoHERAI, R. H.; YAMAGISHI, M. E. B. Detection of human interchromosomal trans-splicing in sequence databanks. Briefings in Bioinformatics, London, v. 2, n. 2, p. 198-209, 2010.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
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14.Imagem marcado/desmarcadoYAMAGISHI, M. E. B.; HERAI, R. H. MappingTools. Versão 1.0. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2009. 1 CD-ROM.
Tipo: Software
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15.Imagem marcado/desmarcadoHERAI, R. H.; YAMAGISHI, M. E. B. Uma ferramenta WEB para identificação e visualização de sequências repetitivas em lócus gênico de animais e plantas. Campinas: EMBRAPA-CNPTIA, 2009. Trabalho apresentado na V Mostra de Trabalhos de Estagiários e Bolsistas, Campinas, out. 2009.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
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16.Imagem marcado/desmarcadoHERAI, R. H.; YAMAGISHI, M. E. B. A Web-based tool for identification and visualization of repetitive sequences within gene loci. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 5., 2009, Angra dos Reis. Abstracts book... Angra dos Reis: ABBCB, 2009. Não paginado. X-Meeting 2009.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
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17.Imagem marcado/desmarcadoHERAI, R. H.; SANTOS, E. H. dos; YAMAGISHI, M. E. B. Algoritmos de bioinformática para detecção de nullomers no transcriptoma humano. In: ENCONTRO ACADÊMICO DE MODELAGEM COMPUTACIONAL, 2.,2009, Petrópolis. Resumos... Petrópolis: Laboratório nacional de computação científica, 2009. p. 35-36. IIEAMC/LNCC 2009.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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18.Imagem marcado/desmarcadoDITA, M.; HERAI, R.; YAMAGISHI, M.; FERREIRA, G.; SOUZA, M.; GIACHETTO, P.; WAALWIJK, C.; KEMA, G. Comparative transcriptome analyses of Fusarium oysporum f. sp. cubense. Phytopathology, v. 101, n. 6, Supplement, p. S43, 2011. Trabalho apresentado no: APS-IPPC 2011 Joint Meeting in Honolulu, Hawaii, August 6-10, 2011.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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19.Imagem marcado/desmarcadoCASTRO, A. de; FRONZA, C. F.; HERAI, R. H.; ALVES, D. Evidence of deterministic evolution in the immunological memory process. In: INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON MATHEMATICAL AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 9., 2009, Brasília, DF. Proceedings... Brasília, DF: BIOMAT Institute for Advanced Studies of Biosystems, 2009. p. 1-14.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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20.Imagem marcado/desmarcadoALVAREZ, J. C.; HERAI, R. H.; CARAZZOLLE, M. F.; PEREIRA, G. G. A. PredIP: an in silico approach for automated protein interaction prediction in genomic and transcriptomic sequence databanks. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 6., 2010, Ouro Preto. Abstracts... [S.l.: s.n.], 2010. p. 85. X-meeting 2010.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
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